Veranstaltung
| Titel | Einführung in moderne bildgebende Methoden und Analyseverfahren |
| Title | Introduction to modern microscopy and image analysis |
| Schwerpunkt/Focus | ZPG |
| Sprache/Language | optional |
| VV-Nr./Course No. | 134182 |
| Modulverantwortlich/Responsible | Prof. Dr. S. Luschnig |
| Vertreter/Co-responsible | |
| Anbieter/Teachers | S. Luschnig, S. Rumpf, M. Bohnert, F. Gunawan |
| Typ/Type | Praktikum, Vorlesung |
| SWS/Semerster periods per week | |
| Arbeitslast(h)/Work load | 150 h |
| KP/Credit points | 5 KP |
| Zuordnung/Classification | Fortgeschrittenen-Modul |
| Semester/Semester | WiSe |
| Studierende/Students | MSc Biowissenschaften MSc Biotechnologie MSc Molekulare Biomedizin |
| Corona-Informationen/Corona-Information | |
| Zeit/Date | Block IV: 5.2. - 1.3.2024 |
| Ort/Location | Kursraum Badestr. ZH 101 |
| Beginn/Start | |
| Vorbesprechung/Obligatory pre-meeting | nach Vereinbarung |
| Voraussetzung/Prerequisite | keine |
| Anmeldung/Registration | online |
| Leistungskontrollen/Performance assessments | Seminarvortrag, Posterpräsentation, Protokoll |
| Termine f. Leistungskontrollen/Date for performance assessments | werden bei Vorbesprechung bekannt gegeben |
| max. NP/Max. grade points | 200 NP |
| Ziele/Aims | Am Beispiel von aktuellen Entwicklungs- und zellbiologischen Fragestellungen sollen die Grundlagen und die Anwendung bildgebender Verfahren (Fluoreszenzmikroskopie, Laser-scanning confocal, spinning disk confocal, light-sheet, hochauflösende Mikroskopie, live imaging) in der modernen Biologie vermittelt werden. Methoden zur quantitativen Analyse und Darstellung von Bilddaten werden eingeführt und sollen anhand eigener Ergebnisse erlernt werden. |
| Inhalte/Content | Die Grundlagen der Fluoreszenzmikroskopie werden eingeführt (Fluoreszenz, verschiedene Mikroskopie-Verfahren, Auflösung, etc.). Mit Hilfe der konfokalen Mikroskopie werden Strukturen und dynamische Prozesse in Neuronen und Epithelzellen in Embryonen und Larven von Drosophila und Zebrafisch, sowie in Hefezellen visualisiert und rekonstruiert. Hochauflösende konfokale Mikroskopiemethoden (Airyscan, deconvolution) werden verwendet, um hiermit die Differenzierung von Neuronen im peripheren Nervensystem von Drosophila zu verfolgen. Die Light-sheet Mikroskopie wird vorgestellt und die Spinning Disc Mikroskopie wird verwendet, um die Dynamik von Epithelzellen und Neuronen zu analysieren. Methoden zur quantitativen Analyse von dynamischen intrazellulären Transportprozessen (FRAP) und Protein-Wechselwirkungen (FRET) werden eingeführt. Fluoreszierende Proteine und Biosensoren (GCaMP u.a.) zur Messung der Dynamik von Calcium-induzierten Signalprozessen werden eingeführt. Die Genetik und Entwicklung von Drosophila wird eingeführt. Moderne genetische Methoden zur Markierung einzelner Zellen werden vorgestellt und angewandt. Zur Analyse der epithelialen Barrierefunktion werden live imaging-Experimente mit fluoreszierenden tracern durchgeführt. Verschiedene Verfahren und Analyse-/Darstellungssoftware (Fiji, Imaris, Omero) zur Analyse und Darstellung (2-D, 3-D) von Bilddaten sowie zur statistischen Analyse der Daten werden eingeführt und angewandt. |
| Methoden/Methods | Epifluoreszenz, Laser-scanning confocal, spinning disk confocal, light-sheet, hochauflösende konfokale Mikroskopie, deconvolution, FRAP, FRET, live imaging, Biosensoren, Calcium-imaging, genetische und zellbiologische Methoden zur Visualisierung von zellulären Prozessen in Modellsystemen (Hefe, Drosophila, Zebrafisch). |
| Berufsrelevante und interdisziplinäre Komponenten/Occupational and interdisciplinary skills | Bildanalyse- und Darstellungssoftware (Fiji, Imaris, Omero), Konzeptualisierung, Visualisierung, Präsentation von Daten in Poster und Vortrag. |
| Voraussetzung für/Prerequisite for | keine |
| Präsenzpflicht/Compulsory presence | ja/yes |
| Plätze/Number of participants | 8 |
| Gruppengröße/Group size | |
| Materialien/Materials | Werden gestellt. |
| Literatur/Literature | Alberts et al.: Molecuar Biology of the Cell. Primärliteratur wird gestellt. |
| Links | http://luschnig.uni-muenster.de/teaching/practical-courses |
| Sonstiges/Further information |
Modulelemente:
Elemente of the module:
| Titel/Title | Zeit (von...bis)/Time (from...to) | Ort(Raum)/Location | |
|---|---|---|---|
| Übungen/Practical exercises | |||
| Vorlesung/Lecture | |||
| Seminare/Semeinars | |||
| Exkursionen/Excursions |
= Modul gehört zum SPP Imoplant / Module is part of the SSP Imoplant
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