| Titel |
Bioinformatik I (Einführung in die Bioinformatische Genomanalyse und Genomik) mit Übung
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| Title |
Bioinformatics I (Introduction to bioinformatics and genomics) |
| Schwerpunkt/Focus |
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| Sprache/Language |
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| VV-Nr./Course No. |
132031 (VL) 132180 (Ü) |
| Modulverantwortlich/Responsible |
Prof. Dr. K. Müller |
| Vertreter/Co-responsible |
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| Anbieter/Teachers |
Prof. Dr. J. Gadau, Dr. L. Schrader |
| Typ/Type |
Vorlesung + Übung |
| SWS/Semerster periods per week |
2 |
| Arbeitslast(h)/Work load |
50 h |
| KP/Credit points |
2 KP |
| Zuordnung/Classification |
Aufbaumodul Ökologie, Evolution und Biodiversität |
| Semester/Semester |
WiSe |
| Studierende/Students |
BSc Biowissenschaften |
| Corona-Informationen/Corona-Information |
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| Zeit/Date |
s. Vorlesungsverzeichnis |
| Ort/Location |
s. Vorlesungsverzeichnis |
| Beginn/Start |
s. Vorlesungsverzeichnis |
| Vorbesprechung/Obligatory pre-meeting |
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| Voraussetzung/Prerequisite |
Solide Grundkenntnisse in Biologie, Chemie und Mathematik (Niveau Grundkurs bis zum Abitur) sind notwendig und müssen daher, falls nicht vorhanden, spätestens im Laufe des Semester durch intensives Selbststudium erarbeitet werden. |
| Anmeldung/Registration |
während der Vorbesprechung |
| Leistungskontrollen/Performance assessments |
Übungen, 1 Klausur (MCQ) gegen Ende der Vorlesung |
| Termine f. Leistungskontrollen/Date for performance assessments |
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| max. NP/Max. grade points |
10 |
| Ziele/Aims |
Teil 1 (Molekulare Evolution):
Verständnis von Struktur und Sequenzevolution, Studenten sollen mit Prinzipien der molekularen Phylogenie vertraut gemacht werden und einfache Programme zur Analyse molekularer Evolution handhaben können, sollen Verständnis für die Zusammenhänge mit populationsgenetischen Aspekten entwickeln und die Prinzipien von adaptiver und neutraler Mutation auf der Ebene von Sequenzen verstehen. Verständnis des Zusammenhanges ultimater und proximater Faktoren.
Teil 2 (Grundlagen von Genomics):
Ziele: Verständnis und Kenntnis der Methoden zur modernen Analyse von Organismen, insbesondere die Genomanalyse, Proteomanalyse und Transkriptomanalyse. |
| Inhalte/Content |
Teil 1 (Molekulare Evolution):
Adaptive und neutrale Evolution, molekulare Uhr, molekulare Evidenz der Red Queen, Taxonomien, Stammbaeume, paraphylie, polyphylie, polytomie, molekulare homologie/orthologie/paralogie, Genomanalyse.
Teil 2 (Grundlagen von Genomics):
Inhalte: Einfuehrung in die grundlegenden Techniken der Gentechnologie, Methoden der Proteomanalyse (Yeast-2-Hybrid und MS Analyse) und der Aufklaerung von Genomsequenzen |
| Methoden/Methods |
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| Berufsrelevante und interdisziplinäre Komponenten/Occupational and interdisciplinary skills |
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| Voraussetzung für/Prerequisite for |
Vertiefungs-Modul Bioinformatik |
| Präsenzpflicht/Compulsory presence |
ja (Übung) |
| Plätze/Number of participants |
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| Gruppengröße/Group size |
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| Materialien/Materials |
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| Literatur/Literature |
Higgs and Attwood: Bioinformatics and Molecular Evolution, Blackwell, 2005.
A.v. Haeseler, D. Liebers Molekulare Evolution -- Fischer, ISBN-10: 3596153654
Sonstige Literatur: wird bekannt gegeben.
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| Links |
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| Sonstiges/Further information |
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= Modul gehört zum SPP Imoplant / Module is part of the SSP Imoplant
= Modul gehört zum SPP Evolution /Module is part of the SSP Evolution
= Modul gehört zum SPP Bioanalytics and Biochemistry /Module is part of the SSP Bioanalytics and Biochemistry
= Modul gehört zum SPP Neuroscience and Behaviour /Module is part of the SSP Neuroscience and Behaviour
= Modul gehört zum SPP Quantitative Cell Biology /Module is part of the SSP Quantitative Cell Biology